Las amebas de vida libre (FLA) pertenecientes a los géneros Naegleria, Acanthamoeba y Hartmanella se encuentran en diversos hábitats acuáticos en todo el mundo. Varias especies de Acanthamoeba y Naegleria fowleri pueden causar infecciones mortales del sistema nervioso central en humanos. En el medio ambiente, Acanthamoeba, Naegleria y Hartmanella pueden albergar bacterias, incluidas aquellas con potencial patógeno. Se encuentran disponibles métodos bioquímicos, inmunológicos y moleculares para detectar, identificar y cuantificar FLA en fuentes de agua domésticas, municipales y recreativas. Se pueden recolectar, centrifugar o filtrar y cultivar volúmenes pequeños o grandes de agua para el crecimiento de amebas en agar no nutritivo recubierto con Escherichia coli (NNA-E. coli). Se encuentran disponibles varios ensayos de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencionales confiables y sensibles para la identificación específica de amebas. Se han desarrollado ensayos cuantitativos de PCR en tiempo real para cuantificar el número de amebas presentes en la muestra. Muchos de los ensayos moleculares son más rápidos y sensibles que las pruebas inmunológicas y bioquímicas. Cultivo de muestras en NNA-E. coli antes de la PCR permite la detección de amebas vivas. Incluye 40 referencias, tablas, figuras.