T/LTIA 13-2021
Especificación para la interoperabilidad de datos de microbiomas en servicios de pruebas genéticas (Versión en inglés)

Estándar No.
T/LTIA 13-2021
Idiomas
Chino, Disponible en inglés
Fecha de publicación
2021
Organización
Group Standards of the People's Republic of China
Ultima versión
T/LTIA 13-2021
Alcance
Durante el proceso de formulación de esta norma, a medida que se profundizó la investigación, se completaron sucesivamente el borrador de discusión de la norma, el borrador y el borrador de solicitud de norma. El contenido de la norma se mejoró continuamente y se volvió más científico y razonable. Según sea necesario, el contenido técnico principal de este estándar se determina como: En términos y definiciones, para metadatos, microbioma, metagenómica, amplicones, formato de matriz de observación biológica, producción de datos, análisis de datos, datos a nivel de análisis, almacenamiento de datos, servicios de datos, Se definen abundancia de genes, abundancia taxonómica, abundancia funcional, abundancia relativa, unidades taxonómicas operativas, formato FASTQ, formato TSV, etc. En el proceso de intercambio e intercambio de datos del microbioma, se describe la producción, transmisión y uso de datos del microbioma. Divida este proceso en cuatro eslabones: producción de datos, análisis de datos, almacenamiento de datos y servicios de datos, y describa los detalles y puntos clave de cada eslabón. En los metadatos de datos del microbioma, el estándar divide los metadatos en tres partes según el vínculo de generación de datos: metadatos asociados con información de muestra, metadatos asociados con datos de secuenciación y metadatos asociados con datos de nivel de análisis, y estandariza cada parte. y elementos mínimos en el intercambio de datos del microbioma. En el formato de datos del microbioma, el estándar estandariza el formato de los datos del microbioma en cada enlace del proceso e introduce formatos comunes como referencia. Dependiendo de la etapa de generación, los datos del microbioma se dividen en datos sin procesar y datos de nivel analítico. Los datos sin procesar del método de secuenciación de alto rendimiento son FASTQ. Los datos a nivel de análisis se refieren a la información de composición microbiana obtenida al analizar los datos originales mediante métodos bioinformáticos. Se propone que se puedan almacenar los formatos TSV (tabulación de texto segmentado) y BIOM. como archivos de datos a nivel de análisis. El formato de archivo utilizado. Además, también se proponen estructuras de datos sugeridas en escenarios de interacción de red.

T/LTIA 13-2021 Historia

  • 2021 T/LTIA 13-2021 Especificación para la interoperabilidad de datos de microbiomas en servicios de pruebas genéticas



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