T/NAASS 013-2022
Código de prácticas para la selección genómica de novillas Holstein (Versión en inglés)

Estándar No.

T/NAASS 013-2022

Idiomas

Chino, Disponible en inglés

Fecha de publicación

2022

Organización

Group Standards of the People's Republic of China

Ultima versión

T/NAASS 013-2022

Alcance

Términos y definiciones Los siguientes términos y definiciones se aplican a este documento. 3.1 Vaca joven Holsteinnovilla holstein se refiere a la vaca Holstein desde el destete hasta el primer parto. 3.2 Pedigrí Pedigrí es un archivo familiar que se utiliza para registrar la fecha de nacimiento del ganado y la información de sus antepasados, incluido el número de ganado, el sexo, la fecha de nacimiento, el padre, la madre, el abuelo, la abuela, el abuelo materno y la abuela materna, etc. 3.3 Fenotipo El fenotipo se refiere a los rasgos que muestran los individuos con un genotipo específico en determinadas condiciones ambientales. Debe estar asociado con un rasgo específico. 3.4 Genotipo Genotipo En la estructura de doble hélice del ADN, la secuencia de nucleótidos de diferentes bases (A/T/G/C) forma un segmento funcional en un determinado párrafo del ADN, que es un gen. Todos los genes La combinación se denomina colectivamente genotipo. 3.5 Medición del desempeño de la producción Mejora del rebaño lechero Mida y registre la producción de leche de las vacas lactantes una vez al mes y recolecte muestras mixtas del ordeño a lo largo del día para medir indicadores de desempeño y salud como la composición de la leche, las células somáticas y la urea. Nitrógeno Combinando la paridad y la información mensual sobre los partos, el ordeño en seco, el sacrificio, la reproducción y otros cambios en el rebaño de vacas, se forma un informe de análisis después del análisis y procesamiento mediante un software especial, que se utiliza para guiar la gestión de la producción ganadera y el trabajo de reproducción. [Fuente: DB/T 1014-2014, 3.1, con modificaciones] 3.6 Clasificación de tipo Para los rasgos individuales de forma corporal de las vacas jóvenes Holstein, el valor máximo de los rasgos se determina de acuerdo con el rango de variación de las características biológicas y el valor mínimo. y luego puntuar en una escala lineal. [Fuente: GB/T35568-2017, 3.1, con modificaciones] 3.7 La población de referencia genómica consta de individuos con información genotípica e información fenotípica, utilizada para estimar el valor genético genómico de una población candidata. 3.8 Valor genético del pedigrí El valor genético individual se estima en función del valor genético estimado de los padres individuales. La fórmula de cálculo comúnmente utilizada es: valor genético del pedigrí = (valor genético del padre * 0,5 + valor genético del abuelo * 0,25) / 0,75. 3.9 Población candidata genómica Grupo compuesto por individuos con genotipos cuyos valores genéticos genómicos deben predecirse. 3.10 Evaluación genética Estimación genética y genómica El proceso de estimación de los efectos genéticos aditivos de los rasgos objetivo de reproducción individuales a través de métodos genéticos cuantitativos y modelos estadísticos es el principal método de evaluación y medio técnico del valor de la cría de vacas lecheras. 3.11 La selección genómica es un método que utiliza marcadores genéticos que cubren todo el genoma para predecir los valores genéticos individuales del ganado y las aves de corral, logrando así una selección temprana de individuos basada en los valores genéticos predichos individuales. [Fuente: GB/T40184-2021, 3.1, con modificaciones] 3.12 Valor genético convencional valor genético estimado utilizando métodos de evaluación genética convencionales, como el basado en la mejor predicción lineal insesgada (BLUP) Un modelo animal que utiliza información genealógica y registros fenotípicos para estimar efectos genéticos aditivos individuales (EBV). 3.13 Valor genético genómico Basado en la información genotípica y fenotípica de los individuos en el grupo de referencia del genoma, el valor genético predicho por el método de evaluación genética genómica para individuos con solo información genotípica se llama valor genético directo (DGV), el valor genético genómico (GEBV). ) se obtiene sumando el DGV y el índice genealógico ponderado de la evaluación genética convencional. 4. El proceso de construcción específico de la plataforma de selección del genoma se implementará de acuerdo con las regulaciones de GB/T 40184. 4.1 Formación de grupos de referencia Este estándar se refiere a la plataforma tecnológica de selección del genoma del ganado Holstein chino para establecer un grupo de referencia, que incluye genotipos individuales de polimorfismo de nucleótido único (SNP) de vacas y toros de verificación, así como la producción de leche, las células somáticas, la forma del cuerpo, etc. 30 Información estimada del valor genético de un rasgo. Generalmente, la información del genotipo de SNP individual se mide utilizando chips comerciales, que incluyen más de 50.000 SNP que cubren uniformemente el genoma. 4.2 La identificación del fenotipado y del tipo de cuerpo se llevará a cabo de acuerdo con las disposiciones de GB/T 3556; la determinación de la descendencia se llevará a cabo de acuerdo con las disposiciones de GB/T 35569; la medición del rendimiento de la producción deberá realizarse de acuerdo con las disposiciones de NY/T 1450. 4.3 Construir una ecuación de predicción Basándose en el método de información genómica de mejor estimación lineal insesgada (GBLUP), se construye una ecuación de predicción utilizando información del genotipo SNP y valores genéticos estimados. El individuo predicho debe tener información del genotipo SNP. 4.4 Clasificación integral del valor genético De acuerdo con la fórmula del Índice de desempeño de selección del genoma lechero chino (Índice de desempeño genómico de China, GCPI), se calcula el valor genético integral del genoma de las vacas jóvenes, y las vacas jóvenes se clasifican de acuerdo con la clasificación integral. valor genético Seleccione vacas jóvenes con los mejores valores genéticos integrales para formar un grupo central. La fórmula de cálculo del GCPI es la siguiente: Donde: GEBVFat, GEBVProt, GEBVSCS, GEBVType, GEBVMS y GEBVFL son los genomas combinados de la cantidad de grasa de la leche, la cantidad de proteína de la leche, la puntuación de las células somáticas, la puntuación de la forma corporal total y la puntuación del sistema de lactancia. , y rasgos de puntuación de extremidades y pezuñas, respectivamente. Valor genético estimado, el denominador es la desviación estándar del valor genético estimado para el rasgo correspondiente. 5 Proceso básico 5.1 Detección del genoma y selección individual de grupos candidatos 5.1.1 Con base en la medición del desempeño de producción de vacas Holstein (DHI) y la base de datos de identificación del tipo de cuerpo, realice una evaluación genética y utilice la clasificación del Índice de desempeño lechero chino (CPI) para seleccionar los mejores. El 25% del ranking del IPC es hija de vaca. 5.1.2 Con base en los registros DHI de las vacas Holstein, se evaluarán las hijas de las vacas que se ubican en el 25% superior de la producción de leche de 305 días, las cantidades de grasa y proteína de la leche y con un puntaje de identificación de la forma del cuerpo de 82 o superior. . 5.1.3 Con base en los valores genéticos del pedigrí Holstein, seleccione el 25% superior de las vacas jóvenes. 5.1.4 Después de las pruebas del genoma, examinar a las hijas criadas por novillas Holstein con los valores genéticos genómicos más altos en índices de selección individuales o integrales. 5.2 Recolección de muestras 5.2.1 Recolección de muestras de sangre: Recoja sangre de la vena yugular o de la vena de la cola bovina. Recoja aproximadamente 3 ml de muestra de sangre y colóquela en un tubo de extracción de sangre de 5 ml que contenga anticoagulante. Se toma aproximadamente 1 ml de sangre anticoagulada y se aplica uniformemente sobre la tarjeta de sangre en un área de aproximadamente 2 cm de diámetro. Las muestras de sangre restantes se congelan a -20°C para su uso posterior. 5.2.2 Muestreo de folículos pilosos: recoja el pelo de vaca de la raíz de la cola de la vaca, arranque de 20 a 30 pelos (las raíces del pelo de vaca arrancado deben tener folículos pilosos blancos) y colóquelos en una tarjeta de recolección de folículos pilosos o en un folículo piloso. tubo de recogida. 5.2.3 Almacenamiento y transporte de muestras Las muestras de sangre deben mantenerse entre 2 °C y 8 °C durante la recolección y el transporte. Se pueden usar bolsas de hielo o hielo seco y sellarlas en cajas de espuma aisladas. Las muestras de folículos pilosos o tarjetas de muestras de sangre se envían por correo a temperatura ambiente y la caja de espuma se llena con espuma plástica a prueba de golpes alrededor de la muestra. 5.3 Extracción de ADN El ADN extraído debe cumplir con los requisitos de calidad y cantidad de la muestra para chips genéticos o secuenciación. El método de extracción de ADN se llevó a cabo de acuerdo con las regulaciones de NY/T1673. 5.4 La determinación del genotipo utiliza chips SNP de genoma completo o métodos de secuenciación del genoma para genotipar las muestras biológicas recolectadas. 5.5 Recopilación de información fenotípica Recopilar y determinar información genealógica del ganado, identificación del tamaño corporal de las madres y datos de medición del desempeño productivo de cada paridad. 5.6 Resultados de la predicción genómica Para los diversos rasgos objetivo de reproducción de las vacas lecheras en 4.1, se utilizan los modelos estadísticos correspondientes para predecir los valores genéticos de los individuos en función de los resultados de la medición del chip, calcular los valores genéticos de cada rasgo de la vaca probada, y luego use la fórmula 4.4 para calcular el GCPI. 5.7 El grupo central se establece para formar un pasto. Con base en los resultados de clasificación calculados por GCPI****, combinados con el rendimiento del crecimiento, la forma del cuerpo y el estado de salud, las decisiones de selección se pueden tomar lo antes posible, las vacas jóvenes sobresalientes pueden ser seleccionados, se puede establecer un grupo central y se puede implementar la selección y el emparejamiento para mejorar continuamente el nivel genético de las generaciones futuras.

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